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當(dāng)前位置：模擬計算 ? 分子動力學(xué) ?

分子動力學(xué)-大分子對接

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分子動力學(xué)-大分子對接

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項(xiàng)目介紹

分別采用HEX，ZDOCK，Rosetta等軟件進(jìn)行蛋白-蛋白對接，蛋白-DNA等對接，驗(yàn)證免疫共沉淀，GST-pull down等實(shí)驗(yàn)結(jié)果，并合理推測結(jié)合位點(diǎn)，并考察蛋白之間結(jié)合穩(wěn)定性及殘基能量貢獻(xiàn)，為實(shí)驗(yàn)后續(xù)結(jié)構(gòu)突變改造提供指導(dǎo)，為文章的寫作錦上添花。

樣品要求

必需輸入： 1. 受體結(jié)構(gòu)文件：干凈的PDB文件，需明確處理方式（如加氫、修補(bǔ)缺失環(huán)）。 2. 配體結(jié)構(gòu)文件：包含正確質(zhì)子化態(tài)和手性的3D坐標(biāo)文件。 3. 關(guān)鍵參數(shù)：配體的電荷、質(zhì)子化狀態(tài)（pH）、力場選擇（如AMBER, CHARMM, OPLS-AA）。建議提供：已知的實(shí)驗(yàn)結(jié)合數(shù)據(jù)或關(guān)鍵殘基信息，用于驗(yàn)證。

項(xiàng)目案例

常見問題

1、Q1、如果計算結(jié)果與預(yù)期不符合怎么辦？

1.科研計算服務(wù)是一個探索的過程，其中存在不確定性。服務(wù)方對理論計算得到的數(shù)據(jù)負(fù)責(zé)，但不保證理論數(shù)據(jù)能夠與預(yù)期結(jié)果完全一致。如果需要可以對模型進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整，調(diào)整過程中若增加計算或者大規(guī)模的重新計算，需增加計算費(fèi)用，價格另行協(xié)商。

2.模擬計算存在不確定性，我們對計算過程的正確性負(fù)責(zé)。計算開始之后會消耗軟件，機(jī)時以及人力成本，所以不支持退款，敬請諒解

2、Q2、模擬計算項(xiàng)目服務(wù)范圍？

1.計算完成之后提供所需的計算方法，計算結(jié)果數(shù)據(jù)和圖文，以及關(guān)于計算結(jié)果中疑問的解答；

2.文章回復(fù)意見中模擬計算問題進(jìn)行適當(dāng)?shù)慕獯穑舴蹈搴笮枰黾佑嬎悖枇硇惺召M(fèi)。

3、Q3、關(guān)于模擬計算下單流程是怎么樣的呢？

1.如果是確定計算需求，可以直接在測試狗官網(wǎng)選擇相應(yīng)的項(xiàng)目進(jìn)行下單，提交訂單時需填寫具體的計算內(nèi)容，預(yù)期結(jié)構(gòu)，分子結(jié)構(gòu)及相關(guān)的參考文獻(xiàn)。如果網(wǎng)站上沒有對應(yīng)的項(xiàng)目請選擇【私人定制】并在需求中寫明具體計算內(nèi)容；

2.如果不能確定計算內(nèi)容，可以直接聯(lián)系工作人員進(jìn)行需求溝通。

項(xiàng)目推薦

分子動力學(xué)-大分子對接

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安心測服務(wù)說明

7天無理由免費(fèi)復(fù)測

1. 復(fù)測保證

如果在訂單完成之后7天內(nèi)對結(jié)果存疑,可申請同條件免費(fèi)復(fù)測，更換條件或者參數(shù)不能參與免費(fèi)復(fù)測保障服務(wù)，全程由專業(yè)團(tuán)隊操作，確保結(jié)果有效性；

2. 具體細(xì)則

每單限1次復(fù)測機(jī)會，單次需小于5個樣品; 此外免費(fèi)復(fù)測樣品必須為同一樣，私人定制、云視頻測試不可享受此服務(wù)；

3. 注意事項(xiàng)

如果由于您自身樣品的情況(樣品有問題/選錯測試條件等)將不可享受此服務(wù)；

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