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當(dāng)前位置:模擬計(jì)算 ?  分子動(dòng)力學(xué) ? 

分子動(dòng)力學(xué)-分子對接

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分子動(dòng)力學(xué)-分子對接

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項(xiàng)目介紹

分子對接(molecular docking)是依據(jù)配體與受體作用的“鎖-鑰原理” (lock&key principle),模擬配體小分子與受體生物大分子相互作用的一種技術(shù)方法。

配體與受體相互作用是分子識(shí)別的過程,主要包括靜電作用、氫鍵作用、疏水作用、范德華作用等。通過計(jì)算,可以預(yù)測兩者間的結(jié)合模式和親和力。

樣品要求
1. 受體結(jié)構(gòu):PDB格式文件,需清理(去水、加氫、處理缺失殘基/原子)。 2. 配體結(jié)構(gòu):小分子的3D結(jié)構(gòu)文件(如.mol2, .sdf),需進(jìn)行能量最小化和質(zhì)子化。 3. 對接參數(shù):指定的對接盒子中心坐標(biāo)和大小(如無,則需溝通確定)。
項(xiàng)目案例
常見問題
1、Q1、如果計(jì)算結(jié)果與預(yù)期不符合怎么辦?

1.科研計(jì)算服務(wù)是一個(gè)探索的過程,其中存在不確定性。服務(wù)方對理論計(jì)算得到的數(shù)據(jù)負(fù)責(zé), 但不保證理論數(shù)據(jù)能夠與預(yù)期結(jié)果完全一致。如果需要可以對模型進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整,調(diào)整過程中若增加計(jì)算或者大規(guī)模的重新計(jì)算,需增加計(jì)算費(fèi)用,價(jià)格另行協(xié)商。

2.模擬計(jì)算存在不確定性,我們對計(jì)算過程的正確性負(fù)責(zé)。計(jì)算開始之后會(huì)消耗軟件,機(jī)時(shí)以及人力成本,所以不支持退款,敬請諒解


2、Q2、模擬計(jì)算項(xiàng)目服務(wù)范圍?

1.計(jì)算完成之后提供所需的計(jì)算方法,計(jì)算結(jié)果數(shù)據(jù)和圖文,以及關(guān)于計(jì)算結(jié)果中疑問的解答;

2.文章回復(fù)意見中模擬計(jì)算問題進(jìn)行適當(dāng)?shù)慕獯?,若返稿后需要增加?jì)算,需另行收費(fèi)。


3、Q3、關(guān)于模擬計(jì)算下單流程是怎么樣的呢?

1.如果是確定計(jì)算需求,可以直接在測試狗官網(wǎng)選擇相應(yīng)的項(xiàng)目進(jìn)行下單,提交訂單時(shí)需填寫具體的計(jì)算內(nèi)容,預(yù)期結(jié)構(gòu),分子結(jié)構(gòu)及相關(guān)的參考文獻(xiàn)。如果網(wǎng)站上沒有對應(yīng)的項(xiàng)目請選擇【私人定制】并在需求中寫明具體計(jì)算內(nèi)容;

2.如果不能確定計(jì)算內(nèi)容,可以直接聯(lián)系工作人員進(jìn)行需求溝通。

分子動(dòng)力學(xué)-分子對接

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安心測服務(wù)說明
關(guān)閉
7天無理由
7天無理由免費(fèi)復(fù)測
1. 復(fù)測保證

如果在訂單完成之后7天內(nèi)對結(jié)果存疑,可申請同條件免費(fèi)復(fù)測,更換條件或者參數(shù)不能參與免費(fèi)復(fù)測保障服務(wù),全程由專業(yè)團(tuán)隊(duì)操作,確保結(jié)果有效性;

2. 具體細(xì)則

每單限1次復(fù)測機(jī)會(huì),單次需小于5個(gè)樣品; 此外免費(fèi)復(fù)測樣品必須為同一樣,私人定制、云視頻測試不可享受此服務(wù);

3. 注意事項(xiàng)

如果由于您自身樣品的情況(樣品有問題/選錯(cuò)測試條件等)將不可享受此服務(wù);

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