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南京大學(xué)黃碩團隊,一天兩篇Nature子刊!
來源: 時間:2024-03-15 11:41:03 瀏覽:3026次

在2024年3月5日,南京大學(xué)黃碩教授團隊Nature Communications上連續(xù)發(fā)表兩篇納米孔測序最新成果,即“Nanopore analysis of salvianolic acids in herbal medicines”“Nanopore analysis of cis-diols in fruits”。下面對這兩篇成果進行簡要介紹!

01
草藥中丹酚酸的納米孔測序

第一作者:Pingping Fan

通訊作者:黃碩教授

通訊單位:南京大學(xué)

DOI: 10.1038/s41467-024-45543-1.

【研究背景】

天然草藥在歷史上被廣泛用于治療多種疾病。草藥中生物活性成分的準(zhǔn)確鑒定和定量對草藥的發(fā)現(xiàn)、生產(chǎn)和質(zhì)量控制至關(guān)重要。然而,由于天然草藥的復(fù)雜性,對其進行定量分析并非易事。納米孔是一種多用途的單分子傳感器,可適合于識別天然草藥中的生物活性化合物?;诖耍暇┐髮W(xué)化學(xué)化工學(xué)院黃碩教授課題組將附著在分枝桿菌孔蛋白A(MspA)上的苯硼酸被用作草藥傳感器,成功鑒定了多種基于丹酚酸的生物活性化合物,包括咖啡酸、原兒茶酸、原兒茶醛、丹酚酸A、迷迭香酸、石精酸、丹酚酸A和丹酚酸B。

【文章要點】

1、課題組開發(fā)了相應(yīng)的機器學(xué)習(xí)算法實現(xiàn)了自動化和多參數(shù)的納米孔數(shù)據(jù)分析,分析物識別的準(zhǔn)確率達到99.0%。這種感應(yīng)原理可進一步用于天然草藥,如丹參、迷迭香和夏枯草等。

2、該傳感器還可以進一步集成到便攜式設(shè)備中,以協(xié)助野外工作或極端情況下的天然產(chǎn)物調(diào)查。通過配備其他化學(xué)修飾,這種納米孔傳感器也可能適用于更多種類的草藥樣品。

【圖文展示】

圖1.用MspA-90PBA鑒別丹酚酸B

圖2.機器學(xué)習(xí)工作流程

圖3.天然草藥中丹酚酸的快速測序

 


02
水果中順式二醇的納米孔測序

第一作者:Pingping Fan

通訊作者:黃碩教授

通訊單位:南京大學(xué)

DOI: 10.1038/s41467-024-46303-x

【研究背景】

天然水果含有大量的順式二醇,但目前還未有相關(guān)報道證明有可以同時識別所有的順式二醇,并且不需要復(fù)雜的樣品預(yù)處理的高分辨率傳感器。納米孔是一種多用途的單分子傳感器,當(dāng)經(jīng)過適當(dāng)?shù)脑O(shè)計,在其管腔中含有特定的反應(yīng)性適配器時,納米孔可以區(qū)分不同的分析物?;诖?,南京大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院黃碩教授課題組制備了單苯硼酸(PBA)修飾的異八聚恥垢分枝桿菌(MspA)納米孔,用以鑒定水果中的順式二醇。

【文章要點】

1、這種MspA可以準(zhǔn)確識別李子、葡萄、檸檬、不同品種的獼猴桃和商業(yè)果汁產(chǎn)品中的1,2-二酚、醛醇、α-羥基酸和糖。

2、在定制機器學(xué)習(xí)程序的輔助下,識別的準(zhǔn)確率為99.3%,并且大大簡化了樣品預(yù)處理。這些結(jié)果表明納米孔可在食品和藥物管理中的廣泛應(yīng)用。

【圖文展示】

圖1.復(fù)雜樣品的納米孔測序

圖2.機器學(xué)習(xí)模擬

圖3.天然果汁的快速測序

圖4.葡萄汁的便攜式納米孔測序

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全部 3小時前 四川
文字是人類用符號記錄表達信息以傳之久遠的方式和工具。現(xiàn)代文字大多是記錄語言的工具。人類往往先有口頭的語言后產(chǎn)生書面文字,很多小語種,有語言但沒有文字。文字的不同體現(xiàn)了國家和民族的書面表達的方式和思維不同。文字使人類進入有歷史記錄的文明社會。
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